Da du nicht dazu geschrieben hast auf welcher Plattform du spielst und in deinem Profil Steam und PS5 steht, gehe ich davon aus, dass du es auf der PS5 versucht hast.
Auf Steam hat nach dem Update nur eine meiner über 70 Mods nicht funktioniert, das war aber wohl ein Fehler von ARK und nicht von der Mod, da es am nächsten Tag nach einem ARK Update wieder funktioniert hat.
Das Problem mit den nicht verschwindenden Bäumen und Steinen ist nicht neu und habe ich nach jedem Serverneustart in meiner Base. Liegt wohl daran, dass sie groß ist und der Bereich etwas zum laden braucht. Nach kurzer Zeit verschwinden die aber.